在当前财政体制改革不断深化的背景下，新会计制度的实施对行政事业单位的财务管理工作提出了更高要求。其中，“应付职工薪酬”作为单位日常运营中的重要科目，其核算方式和账务处理的规范性直接影响到单位的财务报表质量和内部管理效率。因此，如何在新会计制度框架下，实现“应付职工薪酬”科目的顺利衔接与合理核算，成为当前行政事业单位财务管理的重要课题。

首先，应明确新会计制度对“应付职工薪酬”科目的定义与核算范围。根据《政府会计制度》的相关规定，“应付职工薪酬”是指单位因聘用员工而应支付给员工的各种形式的报酬，包括工资、奖金、津贴、补贴、社会保险费、住房公积金等。相较于旧制度，新制度更加注重权责发生制的运用，强调收入与支出的配比原则，从而提升了财务信息的准确性和可比性。

其次，在实际操作中，行政事业单位需结合自身实际情况，对原有会计科目进行调整，确保“应付职工薪酬”科目的核算符合新制度的要求。例如，原制度中可能将部分福利费用归入“其他应付款”或“专项应付款”，而在新制度下，这些项目应统一纳入“应付职工薪酬”科目，以提高财务数据的透明度和一致性。

此外，单位还应加强内部会计控制体系建设，特别是在“应付职工薪酬”的计提、发放和核销环节，建立完善的审批流程和监督机制。通过信息化手段，如财务管理系统和预算管理平台的整合，实现对“应付职工薪酬”全过程的动态监控，避免出现资金挪用、虚列支出等问题。

同时，单位财务人员也应加强对新会计制度的学习与培训，提升专业素养和业务能力。只有真正理解并掌握新制度的核心内容和操作要点，才能在实际工作中做到准确核算、合规管理，为单位的可持续发展提供坚实的财务保障。

总之，新会计制度下行政事业单位“应付职工薪酬”科目的财务核算，不仅是制度执行的需要，更是提升单位整体管理水平的关键环节。各单位应高度重视，积极应对，确保各项财务工作平稳过渡、高效运行。